该合同性质上是分包合同。其理由是：被编入项目经理部下的土方一队、隧道一队的施工队伍隶属于工程总承包人之外的其他建筑公司，虽然在表面上以总承包人的项目经理部的土方一队、隧道一队的名义施工，但关键要看土方一队、隧道一队的编制是否真在法律上已成为该建筑公司的内部机构，还要看土方一队、隧道一队的负责人即项目经理是否注册在该建筑公司。实践中许多类似情况，其法定手续根本没有办理过，只是名义上对外称呼而已。如果是这样，那么本质上还是两家单位之间形成的专业工程的发包和承包关系，因此，该合同性质上是分包合同，而不是内部承包合同。